在第一章裡使徒保羅強調錯謬的教導會敗壞人的家庭（1:11），這一章勉勵神的工人，要堅立家庭，對信徒的勸勉與教導是從對家庭中各種樣的人開始的(v1-10)。這種教導是以正確的救恩真道為基礎（v11-15），而且信心的行為和生活的表現是合而為一的。
本章的開頭詳述了保羅從神所受的託付，為本書餘下的內容鋪下了基石，是所有服事神者的『共信之道』(一1-4)。本章針對當時革哩底島的異端特徵，有扼要且明確的敘述，給了我們非常寶貴的衛道(護教)資料(一10-16)。
在本段經文中，保羅用他自己向神那種忠誠的心志，以及多年傳道的經驗來教導提摩太，要他在神面前，生命不息就要忠心事奉主，傳揚主道。
本章特別提醒我們末世的危險，以及教會在真理、屬世的環境上，所遇到的種種試探和困難。末世的人心冷淡，輕看道德、真理。
保羅在本段經文中勉勵提摩太作無愧的工人，不但在神面前，需按著正意分解真理的道，認識那些異端的危險、追求聖潔的個人生活，逃避少年人的私慾，且要與那些愛主的人在一起追求靈性上的長進，作主的忠僕，用溫柔的心對待教會的眾人；就是那些反對自己、抵擋自己的，也應該用溫柔的心來對待他們，這樣才能對神對人常存無虧的心。
在本段中，保羅用了一些很好的比喻，描述基督徒是何等人：是教師、是精兵、是武士、是農夫、是犯人……，他勉勵提摩太要勇敢、剛強地為真理爭戰。我們既然是主的僕人，就是主的精兵，應該死心塌地的為我們的主效力。不自誇、不怕死，把一切纏繞我們的瑣碎事情都撇下，單單求主的喜悅。
主後六十四至六十五年，保羅在馬其頓各地作工，留提多在革哩底(多一5)，提摩太在以弗所(提前一3)。他有意往尼哥波立過冬並會見提多(多三12)之後，前往亞西亞會見提摩太(提前三14；四13)，但卻他再次被捕。提摩太後書約在主後六十七年保羅為主殉道之前，寫於羅馬監獄。當時，保羅預知自己大難將臨(提後四6)，乃寫本書信有意將他的事工移交給提摩太，又叫提摩太知人善任，故信中提到許多人的名字，有好有壞。
保羅在本書將結束時，再提到這些傳異教之人的情形，這些話不但是對提摩太講，也是對提摩太所牧養的以弗所教會講，使信徒知道使徒保羅對這些假師傅的態度。他們是完全與基督敵對的，不服從主耶穌基督純正的話與合乎敬虔的道理。
在這一段經文，似乎是使徒保羅對年輕的提摩太處事待人的教導，但我們不能忽視“聖經都是神所默示的，於教訓督責，使人歸正，教導人學義，都是有益的。”因此聖經裡的話，固然有當時特定接受的人，但也同時是為所有神的兒女。
在這一段經文，使徒保羅論述了什麼是合神心意的工人。三章1-13節保羅剛提過教會長老和執事的資格，在此保羅向提摩太論到“基督耶穌的好執事”，他們不一定在教會裡擔任職務，卻是按著在基督面前心靈所受的感動，從主所領受的責任來忠心服事，所以也就是基督耶穌的好執事。保羅在此勸勉信徒要作基督耶穌的好執事，並怎樣才能成為基督耶穌的好執事 – 合神心意的工人。